ウイルス変異株に対して細胞傷害性T細胞（CTL）が抗ウイルス機能を保持できるかなど、COVID-19におけるCTLの役割は不明な点が多い。本研究では、回復者とワクチン接種者で誘導されるCTL応答の抗原特異性、変異株への感受性変化や抗ウイルス活性を解析した。まず始めに、日本人でアリル頻度が最も高いHLA-A24に提示される抗原ペプチドとしてSpike448-456のNYNYLYRLF (NF9)領域に着目したところ、新たに出現した新型コロナウイルス変異株として、デンマークからL453F変異が、カリフォルニアやインドからはL452R変異が、南米からはL452Qが報告された。一方、同じくHLA-A24に提示されるSpike1208-1216のQYIKWPWYI (QI9)領域は、これまでのところよく保存されていた。回復者とワクチン接種者から供与を受けたPBMC検体を用いて、両エピトープに特異的なCTL応答を調べたところ、QI9に対する応答は変異株に感染した回復者でもほぼ一定であったが、デルタ株（L452Rを持つ）に感染した回復者ではNF9に対する応答は全く認められなかった。NF9特異的な応答は変異株に対して変動しやすい性質を持つことが明らかになった。一方、オミクロン株BA.1およびBA.2に対する応答を調べたところ、QI9特異的な応答には変化がなく、すべての変異株に対して有効性が保持されていた。各エピトープに特異的なT細胞レセプター（TCR）をクローニングしたところ、変異株に対する応答性が再確認された。以上のことから、感染あるいはワクチン接種において誘導された免疫応答では、中和抗体応答に比べて、ウイルス変異株に対するT細胞の優位性が示唆された。