薬効評価モデル構築については、長崎大学において独自に単離したウイルス株を用い致死性を示すSARS-CoV-2動物感染モデルを構築した。また、異なる動物種を用いたSARS-CoV-2感染の重症化モデルにおいて、CT画像及びエーザイでの病理像解析により動物モデルにおける肺炎像の基礎データも取得している。また、国立国際医療研究センターでは、急性呼吸窮迫症候群（ARDS）に対する治療効果を確認するため、非ウイルス性ARDSモデルの構築を進め、構築した病態モデルにおいて肺炎症状の発現をCTや呼吸機能測定機器（NAM）で確認している。現在、治療薬シーズなどを用いて、薬効評価モデルとしての検証を進めている。
バイオマーカー探索については、横浜市立大学附属病院のCOVID-19重症患者から採取した肺胞洗浄液（BALF）細胞ならびに末梢血単核球（PBMC）のシングルセルRNAシーケンス（RNA-seq）を施行し、パブリックデータと合わせてBALF細胞とPBMCにおける網羅的遺伝子発現解析を行い、特有の遺伝子発現パターンを見い出しつつある。また、横浜市立大学附属病院で採取した軽症・中等症・重症患者の血漿についてカン研究所と連携しプロテオミクスデータも取得した。カン研究所においてプロテオミクス解析を実施した結果、重症患者で顕著な増加を示す因子が認められている。これらの因子は、入院時に中等症を呈しその後重症化（気管挿管）した患者で増加傾向が認められた。臨床サンプルを取得しバイオマーカー解析、RNA-seq解析を進めることで、COVID-19の重症化メカニズムを理解する基盤を構築した。国立国際医療研究センターでは血漿サンプルと肺胞洗浄液の脂質分析を実施した。血漿や肺胞洗浄液はウイルスを不活化できるRNA抽出液AVLと混合されているため、その溶液から脂質を抽出し、分析できることを確認した。続いて、患者血漿より脂質メディエーターである脂肪酸代謝物を包括的に分析した。今後、RNA-seq解析、プロテオミクス解析および脂質解析を含めた統合解析を実施すべく検討している。