東北6県のゲノム分子疫学調査から結核感染の地理的範囲を推計した。疫学的接触が疑われる群は有意に近距離で発生しており（分離距離の中央値：0 km vs 127 km, p<0.01）、63%は同一保健所管内で発生していた（御手洗・村瀬）。
潜在性結核感染症と健常対象の全血を用い、non-coding RNAを含めた網羅発現解析を行い、2つの新規宿主RNAバイオマーカー候補を得た。発現量を疾患/対照パネルで測定するためRT-qPCRの条件を検討した（慶長）。
肉芽腫における結核菌生存関与転写因子を明らかにし、C3HeB/FeJマウスで増殖阻害される14転写因子変異株における転写を低酸素状態とで比較した。様々な変異株において、宿主寄生に関する遺伝子群の発現が低下していた（瀬戸）。
代謝活性等の揃った少数菌集団の網羅的発現解析を実施した。呼吸活性の高低の菌集団間では、機能不明蛋白や膜貫通蛋白、脂肪酸不飽和化酵素等をコードする68遺伝子が活性制御因子候補となった（髙木）。
抗酸菌35種38株の基礎形態をcryo-TEMで観察した。Guptaらの抗酸菌5属の菌体直径、菌体長、菌体周囲長、真円度、aspect ratioで多くの有意差が観察され、分類の妥当性が示唆された（山田）。
TGS-TB v2に抗結核薬14剤への薬剤感受性予測ツールを追加し、INH及びPZA感受性変異を中心に1,686登録へ増強した。GReATデータベース支援のため、結核菌ゲノム情報(53,672株)をゲノム統合サイトgGENEPIDで公開し、感染リンク追跡ソフトHaplotype Explorer を開発した（黒田）。
多剤耐性結核菌の体内動態からgyrA S91PとrpoB V170Fの二重変異とrpoC V483A変異によるエピスタシスを見出した。大阪湾岸域に蔓延するRFP単独耐性株を検知し、rpoC変異と低濃度RIF耐性を明らかにした（岩本）。
分解能が極めて高いとされる比較ゲノム菌株解析だが、長期排菌者を含む集団事例においては後ろ向き疫学調査との推定齟齬が散見された。集団事例初発株を参照配列とした高精度比較ゲノム解析でも精度向上は限局的であった（和田）。
結核菌臨床分離株の系統別必須遺伝子網羅比較解析を実施するために必要な、Tn-Seq法やCRISPRi法などの実験手法確立等、基盤技術構築に成功した（港）。