難培養微生物の分離培養　2019年度は、健常成人2名の糞便から種々の血液寒天培地などを用いて嫌気培養を行い828株の微生物株を分離した。16S rRNA遺伝子配列の類似度の比較などから新菌種であると考えられる菌株について、順次分類学的研究を行いバイオリソースとして整備した。既に酢酸を産生するFaecalimonas umbilicata（Sakamoto et al., IJSEM, 2017）、乳酸を産生するParolsenella catena（Sakamoto et al., IJSEM, 2018）、酪酸産生菌Lawsonibacter asaccharoryliticus（Sakamoto et al., IJSEM,2018）およびSutterellaceae科に属する新菌種（Sutterella megalosphaeroidesおよびMesosutterella multiformis）（Sakamoto et al., IJSEM, 2018）を発表しているが、当該年度はAlistipes属に属する3種（Alistipes communis、Alistipes disparおよびAlistipes onderdonkii subsp. vulgaris）（Sakamoto et al., IJSEM, 2020）とコハク酸を利用する新菌種Dialister hominis（Sakamoto et al., IJSEM, 2020）を発表した。また、昨年度に発表した乳酸を産生するParolsenella catena（Sakamoto et al., IJSEM, 2018）はLibanicoccus massiliensis（フランスのグループがカルチャロミクスで分離、新種提唱した菌種）と近縁であったが、比較ゲノム解析の結果、L. massiliensisはParolsenella属に含まれることが明らかとなり、Parolsenella massiliensisとして新組み合わせを提唱した。微生物間共生機構の解明　微生物間共生機構を解明する一助としてBacteroides thetaiotaomicronとPhascolarctobacterium faeciumの2菌種を実験モデルとして共培養を行なった結果、B. thetaiotaomicronの存在下でP. faeciumの生育が促進されることが既に明らかとなっているが、当該年度は共培養時におけるRNA-Seq解析を行った。その結果、両菌種とも共培養時において特徴的な遺伝子発現をしていることが明らかとなった。