本研究では、アレルギー性気道炎症の詳細な病態解明を達成するため、上皮細胞/自然免疫細胞/樹状細胞/T細胞/好酸球のトランスクリプトーム・エピゲノム・スーパーエンハンサー(SE)の経時的/網羅的な解析を行い、各種細胞の未知の重要な因子、各種細胞間の相互作用を時間・空間的に解明し、新たな病態の理解に基づく創薬基盤を確立するとともに、ステロイド非感受性経路を同定し、難治性喘息の治療ターゲットのシーズ探索を行う。
本年度は、昨年度完了したH3K27ac ChIP-seqを用いたスーパーエンハンサー解析により、各種細胞における約1200のスーパーエンハンサー領域を同定した。抽出したマウススーパーエンハンサー領域を、対応するヒトゲノム領域へと変換し、気管支喘息関連SNPs、アレルギー性疾患関連SNPsがその領域に集積するか否かを検討したところ、各種細胞のスーパーエンハンサーにおいて、ヒトの気管支喘息・I型アレルギー関連SNPsの集積を認めた。疾患コントロールとして肺を病態の主座とするCOPDにおいても同様の検討を行ったが、いずれの細胞種においても低い集積しか認めなかったため、本研究におけるスーパーエンハンサー解析の妥当性が確認された。
さらに気管支喘息における相互作用の同定のため、サイトカイン・ケモカインネットワーク解析を施行した。アレルギー性気道炎症において早期の樹状細胞活性化が各種細胞に刺激を伝達すること、アレルギー性気道炎症の進展とともに炎症の型が連続的に変化することを明らかとした。
引き続き、細胞表面分子を介した相互作用の同定と、細胞内転写プログラム変化の解明、そして炎症の早期に誘導され各種細胞を刺激していると考えられる樹状細胞産生分子Xの抑制によるアレルギー性気道炎症制御の評価を行う予定である。