広島大学では、日本原産の二倍体野生ギクであるキクタニギク(Chrysanthemum seticuspe) の自家和合性突然変異体を繰り返し自殖・選抜することにより、遺伝的に純系化されたGojo-O系統を育成し、キク属モデル植物と位置付けている。本課題では、この系統をモデル系統として確立するために、染色体の高次構造解析や全ゲノム塩基配列決定におけるスキャフォールディングに用いられるHi-C解析と呼ばれる手法を用いて全ゲノム塩基配列解読を実施し、高完成度の全ゲノム塩基配列の構築を目指した。Gojo-O系統の若い葉から抽出した高純高分子・高純度のゲノムDNAをillumina HiSeq2500シーケンサーおよびPacBio Sequelを用いて塩基配列決定を行った。データ量は、illuminaシーケンサで約3,174億塩基(ゲノムサイズの約99倍)、PacBioでの約3,430億塩基(ゲノムサイズの約107倍)に相当した。アセンブルの結果、総塩基数が30.5億塩基、N50が27.7万塩基という結果が得られた。一方、スキャフォールディングのためにGojo-OからHi-Cライブラリを作成し、約4億リードペアのシーケンスを得た。上記アセンブル配列を用いてHi-Rise法を用いてスキャフォールデイングを行ったが、目標としていたスキャフォールド長を得ることは出来なかった。今後、アセンブル配列の高度化・高精度化をさらに進め、再度スキャフォールディングを行うことで目標としていたレベルの精度の全ゲノム塩基配列を得ることを目指す。