がん領域における臨床ゲノム情報データストレージの整備に関する研究
研究課題情報
- 課題管理番号
- 18kk0205005h0003
- 9つの連携分野プロジェクト
疾病克服に向けたゲノム医療実現プロジェクト
- 事業名
臨床ゲノム情報統合データベース整備事業
- タグ(2018)
研究の性格: 生命・病態解明等を目指す研究
開発フェーズ: 該当なし
承認上の分類: 薬機法分類非該当
対象疾患: 新生物
- タグ(2017)
研究の性格: 生命・病態解明等を目指す研究
開発フェーズ: 該当なし
承認上の分類: 薬機法分類非該当
対象疾患: 新生物
- タグ(2016)
研究の性格: 生命・病態解明等を目指す研究
開発フェーズ: 該当なし
承認上の分類: 薬機法分類非該当
対象疾患: 新生物
- 代表研究機関
- 独立行政法人国立病院機構名古屋医療センター
- 研究代表者
(2018) 堀部敬三, 独立行政法人国立病院機構名古屋医療センター, 臨床研究センター・臨床研究センター長
(2017) 堀部敬三, 独立行政法人国立病院機構名古屋医療センター, 臨床研究センター・臨床研究センター長
(2016) 堀部敬三, 独立行政法人国立病院機構名古屋医療センター, 臨床研究センター長
- 研究期間
- 2016年度 - 2018年度
- 課題への総配分額
- 660,000 千円
- 研究概要(2018)
- 臨床研究として収集された臨床情報を有する試料を用いてゲノムシーケンスを行い、臨床現場で利用可能な統合データベースを構築する。多施設共同研究の枠組みで、クリニカルシーケンスの実装を通じて体制整備する。
- 研究概要(2017)
- 臨床研究として収集された臨床情報を有する試料を用いてゲノムシーケンスを行い、臨床現場で利用可能な統合データベースを構築する。多施設共同研究の枠組みで、クリニカルシーケンスの実装を通じて体制整備する。
- 研究概要(2016)
- 造血器腫瘍領域のゲノム医療の実現を目指して、臨床・ゲノム情報を統合したデータストレージを進めるとともに、クリニカルシーケンスを可能にする体制の整備を進める。
研究成果情報
2018
2017
2016
成果の概要
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造血器腫瘍領域におけるゲノム医療の実装に向け、3つのプロジェクトを実施した。 1.多施設共同研究「造血器腫瘍におけるクリニカルシーケンスの実行可能性に関する研究」を造血器腫瘍4疾患、AML(小児・成人)、ALL(小児)、DLBCL(成人)、MM(成人)各25症例(合計100症例)を対象に実施した。標準化された患者説明パンフレットを作成し、予め遺伝カウンセリング提供体制を整備した。研究参加した患者の試料は、名古屋医療センターにおいて、331遺伝子からなる造血器腫瘍標的遺伝子パネルを用いたターゲットシーケンスを行い、シーケンサーで得られたリード情報を東京大学医科学研究所の解析パイプラインGenomon2を用いて体細胞変異を同定した。得られた変異情報に対しアノテーション情報を付与した後に、専門委員会において臨床的意義付けを評価し、臨床還元が診療上有用と考えられる情報について担当医に臨床的意義を付与した解析結果を返却した。これまでに計画通り合計100例が登録され、2症例の不適格症例を除く98症例に対しクリニカルシーケンスを実施し、解析中の4症例を除いて全症例に報告書を返却した。2019年6月には全例の報告書返却が完了する見込みである。また、二次的に生殖細胞系列変異を認めた患者家族には、希望に応じて遺伝カウンセリングを提供した。本研究により造血器腫瘍領域のクリニカルシーケンスの実施における実務上の課題が明らかになった。 2.既に終了した臨床試験の登録症例を主たる対象に造血器腫瘍の臨床ゲノム情報データストレージ(DS, Knonc, https://knonc.com)を構築した。予後情報を含むCDISCに基づき標準化された臨床データと本事業等で解析されたゲノム情報をデータベース化した。事業終了時の進捗状況は、ゲノム解析済み症例数4415例(うち本事業での解析3421例、うち2018年度339例)、ゲノム解析中(2018年度451例)、臨床情報取得済み2384例、DS登録2384例(2018年度0例)、MGeND登録994 例(2018年度0例)である。また、DSに登録されたデータを有効に利活用するためデータ管理運営委員会設置し、委員会規程、データ管理規程、データ利用規程を定めた。 3. 平成29年度10月より保険収載を目指した造血器腫瘍パネルの開発プロジェクトを立ち上げ、造血器腫瘍ゲノム検査ガイドライン(日本血液学会)に掲載された臨床的意義が報告されている遺伝子異常を網羅する遺伝子パネルの開発を企業等と共同して開始した。
学会誌・雑誌等における論文一覧
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1. Kawashima N, Akashi A, Nagata Y, Kihara R, Ishikawa Y, Asou N, Ohtake S, Miyawaki S, Sakura T, Ozawa Y, Usui N, Kanamori H, Ito Y, Imai K, Suehiro Y, Kitamura K, Sakaida E, Takeshita A, Suzushima H, Naoe T, Matsumura I, Miyazaki Y, Ogawa S, Kiyoi H; Japan Adult Leukemia Study Group (JALSG), Clinical significance of ASXL2 and ZBTB7A mutations and C-terminally truncated RUNX1-RUNX1T1 expression in AML patients with t(8;21) enrolled in the JALSG AML201 study. Annals of Hematology. 2019 Jan, 98, 83-91, doi: 10.1007/s00277-018-3492-5
学会・シンポジウム等における口頭・ポスター
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1. がん領域における臨床ゲノム情報データストレージの整備、口頭、 齋藤俊樹、近藤修平、山本松雄、堀部敬三 第 80 回日本血液学会学術集会 2018.10.13 国内
国内 / 口頭
2. Clinical significance and prognostic analyses of PTPN11, RAS, and CBL mutations in pediatric AML 、口頭、Takeo Kaburagi , Genki Yamato , Norio Shiba , Yusuke Hara , Kentaro Ohki , Manabu Sotomatsu , Hirokazu Arakawa , Nobutaka Kiyokawa , Daisuke Tomizawa , Souichi Adachi , Takashi Taga , Keizo Horibe , Yasuhide Hayashi The 80th Annual Meeting of the Japanese Society of Hematology 2018.10.14 国内
国内 / 口頭
3. Genomic and clinical characterization of adult B-cell acute lymphoblastic leukemia 、口頭、Takahiko Yasuda , Dai Nishijima , Shinya Kojima , Masahito Kawazu , Toshihide Ueno , Shinobu Tsuzuki , Hitoshi Kiyoi , Itaru Matsumura , Yasushi Miyazaki , Keizo Horibe , Hiroyuki Mano , Tomoki Naoe , Masashi Sanada , Fumihiko Hayakawa The 80th Annual Meeting of the Japanese Society of Hematology 2018.10.12 国内
国内 / 口頭
4. がん領域における臨床ゲノム情報データストレージ(Knonc)の整備、口頭、齋藤俊樹、濱野康司、安田貴彦、近藤修平、真田昌、齋藤明子、堀部敬三、第 1 回日本メディカル AI 学会学術集会、2019/1/26、国内
国内 / 口頭
5. がん領域における臨床ゲノム情報データストレージの整備、ポスター、齋藤俊樹、濱野康司、安田貴彦、近藤修平、真田昌、齋藤明子、堀部敬三、日本臨床試験学会第 10 回学術集会総会、2019/1/25、国内
国内 / ポスター
6. Landscape of Driver Mutations and Their Clinical Impacts in Pediatric Patients with B-Progenitor Acute Lymphoblastic Leukemia, 口頭, Hiroo Ueno, Kenichi Yoshida, Yasuhito Nannya, Yuka IijimaYamashita, Yusuke Shiozawa, Yuichi Shiraishi, Tomomi Ishida, Hiroyuki Tsukamoto, Keisuke Kataoka, Tetsuichi Yoshizato, Hideki Makishima, Nobuyuki Kakiuchi, Masafumi Seki, Syunsuke Kimura, Tomoya Isobe, Mayumi Kibe, Hiroko Tanaka, Kenichi Chiba, Takao Deguchi, Atsushi Sato, Yoshiko Hashii, Sadao Tokimasa, Junichi Hara, Yoshiyuki Kosaka, Koji Kato, Toshihiko Imamura, Satoru Miyano, Kentaro Ohki, Nobutaka Kiyokawa, Atsushi Manabe, Keizo Horibe, Seishi Ogawa, Masashi Sanada, 29th Annual Meeting of the International BFM study Group, 2018/5/20, 国外
国外 / 口頭
7. The Prognostic Value of TP53 Mutations Depends on Clinical Backgrounds in Pediatric Patients with Acute Lymphoblastic Leukemia, ポスター, Hiroo Ueno, Kenichi Yoshida, Yasuhito Nannya, Yuka Iijima-Yamashita, Yusuke Shiozawa, Yuichi Shiraishi, Tomomi Ishida, Hiroyuki Tsukamoto, Keisuke Kataoka, Tetsuichi Yoshizato, Hideki Makishima, Nobuyuki Kakiuchi, Masafumi Seki, Syunsuke Kimura, Tomoya Isobe, Mayumi Kibe, Hiroko Tanaka, Kenichi Chiba, Takao Deguchi, Atsushi Sato, Yoshiko Hashii, Sadao Tokimasa, Junichi Hara, Yoshiyuki Kosaka, Koji Kato, Toshihiko Imamura, Satoru Miyano, Kentaro Ohki, Nobutaka Kiyokawa, Atsushi Manabe, Keizo Horibe, Seishi Ogawa, Masashi Sanada, 第 60 回米国血液学会, 2018/11/13, 国外
国外 / ポスター
8. Comprehensive Analysis of 343 Genes Using Targeted Sequencing Panel By Next-Generation Sequencer in 77 Pediatric AML Patients with Normal and Complex Karyotypes: JCCG Study, JPLSG AML-05,ポスター、 Kaburagi T, Yamato G, Shiba N, Yoshida K, Hara Y, Shiraishi Y, Ohki K, Sotomatsu M, Arakawa H, Matsuo H, Shimada A, Kiyokawa N, Tomizawa D, Taga T, Horibe K, Miyano S, Ogawa S, Adachi S, Hayashi Y,第 60 回米国血液学会、サンディエゴ(米国)、2018/12/9-12、国外
国外 / ポスター
9. Clinical significance of mutations of RAS pathway related genes including PTPN11, RAS, and CBL genes in pediatric AML -the JCCG study, JPLSG AML-05-. ポスター Kaburagi T, Yamato G, Shiba N, Hara Y, Ohki K, Sotomatsu M, Arakawa H, Kiyokawa N, Tomizawa D, Adachi S, Taga T, Horibe K, Hayashi Y. 50th Congress of the International Society of Pediatric Oncology (SIOP), Kyoto, 2018.11.17, 国内
国内 / ポスター
10. Prognostic impact of neutropenia period in patients with acute myeloid leukemia (AML) enrolled in the Japanese Pediatric Leukemia/Lymphoma Study Group AML-05 study. ポスター Aoki T, Takahashi H, Tanaka S, Shiba N, Hasegawa D, Iwamoto S, Terui K, Moritake H, Nakayama H, Shimada A, Koh K, Goto H, Kosaka Y, Saito AM, Horibe K, Kinoshita A, Tomizawa D, Tawa A, Taga T, Adachi S: 50th Congress of the International Society of Pediatric Oncology (SIOP), Kyoto, 2018.11.18, 国内
国内 / ポスター
「国民との科学・技術対話社会」に対する取り組み
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1. がんと遺伝子検査、倉橋浩樹、藤田保健衛生大学・公開講座、2018/8/15、国内
国内
2. がんの遺伝子検査、倉橋浩樹、名古屋市公開講座「がんについて、今伝えたいこと~予防・治療・共生~」、2018/12/12、国内
国内
3. 胎児の遺伝子を検査する新出生前診断が拡大へ。妊婦を支援する認定遺伝カウンセラーとは?、倉橋浩樹、CBCラジオ・北野誠のズバリサタデー「今週のここ掘れニュース」、2019/2/9、国内
国内