（1） DAA治療効果・耐性化を規定するウイルス因子の解析と臨床応用・ DAA高度難治変異であるNS5A-P32あるいはP29欠失変異由来について検討､前治療歴がSMV＋PegIFN/RBV→DCV/ASV、DCV/ASV、あるいはSOF/LDV症例の治療不成功症例の数%において出現することを示した。一方、DCV/ASV不成功症例の中には高度耐性のA92K変異も出現する場合があることを示した (持田・疋田・黒崎・榎本) 。・ GLE/PIBを用いたgenotype 1型におけるDAA再治療不成功にNS5A-Q24K, L28M, R30E, Q54H/Y, A92Kの多重変異が関係している可能性を示した(鈴木)。（2） DAA治療後の発癌抑止、肝機能・線維化改善におけるウイルス因子の検討・ 抗ウイルス治療前のHCVゲノム配列とSVR後肝癌との関連について検討、HCVコア70番変異型+IL28B TTの場合、肝発癌が生じやすいことを示した（榎本）。・ HCV排除後肝癌における癌関連遺伝子変異プロファイルについて検討、最も頻度の高い変異はhTERTであること、担癌患者のhTERT変異を血中でリキッドバイオプシーとして定量測定しうることを示した(榎本・朝比奈)。（3） DAA治療耐性化・病態進展・発癌におけるウイルス因子の基礎的メカニズムの解明・ HCV subgenomic-repliconシステム、あるいは完全粒子産生HCVシステムを用い、P32欠損を導入し薬剤感受性を検討し、NS5A阻害剤に対して強い耐性を有すること、HCVプロテアーゼ阻害剤等に対しては、野生株と同様の感受性を有することを示した (須田・朝比奈)。・ NS5A-A92K変異型HCV感染マウス、あるいはNS5A-P32 deletion（P32del）変異型HCV感染マウスを構築、GLE/ PIBに抵抗性であること、変異型HCVに加えて野生型HCVの比率を高めると排除できる場合があること、sofosbuvirを加えると排除されることを示した（今村）。・ 非代償性肝硬変におけるRAVについて、signature RAVの頻度に違いはないことを示した(榎本)。（4） C型肝炎の病態形成におけるウイルス因子の検討・ 次世代シークエンス技術を使い、患者血液検体からＨＣＶゲノム情報を高効率に決定し、DAA治療効果予測を自動判定する人工知能(AI)を用いた技術基盤を開発した (上野）。・ 肝がん合併C型肝癌組織におけるHLA-DPB1分子のmRNA発現亢進に遺伝子バリアントが関係する可能性があること、癌部においてDPB1mRNAを発現する免疫担当細胞の多くはM2マクロファージと樹状細胞である可能性を示した(中本) ・ 一分子シーケンサーを用い、肝移植症例におけるDAA不成功症例について、NS5A P32欠失をもつ症例を解析すると、複数のクローンが起源となってP32欠失を獲得し、さらに他部位の複数の変異を獲得していくことが示唆された(上田)。