（１）乳幼児アレルギー疾患の病態に関わる臨床マーカーの探索：①出生コホート解析から、母乳中可溶性CD14量の低値が９か月での卵白感作に関連することが明らかとなった。この結果は、母乳中の自然免疫賦活作用を持つ分子がアレルギー発症に抑制的に働くことを示している（投稿準備中）。②臍帯血中マイクロRNAであるHsa-mir-144-3pが、乳児期のアトピー性皮膚炎発症に関連することを明らかにした。Hsa-mir-144-3pを皮膚ケラチノサイトに導入すると、自然免疫分子であるtoll用受容体を介する刺激による炎症反応を増幅することが判明し、皮膚そう破や黄色ブドウ球菌定着による炎症誘導が促進される可能性があると考えられた（J Allergy Clin Immunol 2018発表）。これらの結果は、母乳中および臍帯血中の免疫活性物質がアレルギー発症予知マーカーとなり、またその機序解明を通じて新薬の開発につながる可能性を示している。（２）アレルギーに関わる腸内真菌の関与の解析：次世代シークエンサーを用いてアトピー性皮膚炎を発症した新生児と母親の糞便を解析した。健常な新生児の糞便はカンジダが優勢であり、アトピー性皮膚炎を発症した新生児の糞便中には様々な真菌が混在するという結果が得られた。また、マウスの腸内真菌定着モデルを作成し、これに野生型マウスの糞便を移植すると消化管の真菌が排除されたことから、消化管への真菌定着に対する腸内細菌の阻害効果が示された（Microbiology and Immunology掲載予定）（３）アレルギー病態形成における黄色ブドウ球菌の役割と母子間伝達の解析：黄色ブドウ球菌選択培地上で異なる形状のコロニーを複数採取した検体であっても、同一児、同一時点で採取された菌株は全ゲノム解析では同一株であることを確認した。また、RNA３発現を検討したところ、一部の菌株で先行研究と同様RNA３の低下が認められた。これらの株のうち非AD発症群では、flame shift変異などのタンパク構造に変化を起こす変異が検出された。糞便からの黄色ブドウ球菌の単離は3割程度の糞便サンプルから単離可能であった。論文投稿に伴い新規解析方法の必要性が生じたため、やや遅れているが、母子のすべての菌株のシークエンスは終了している。