国際連携プロジェクトPCAWG（Pan-Cancer Whole Genome）にてがん免疫ゲノム解析の中核を担い、2800症例の全ゲノムとRNA-seqデータをもとに、HLA解析、Neoantigen解析、T-cell inflamed signature解析など様々な視点での免疫ゲノム解析を行った。Pan-CancerでのT-cell inflamed signatureを解析し、inflamed群（HOT）と非inflamed群 （COLD）に群別化を行った上で、HOT/COLD間でのGSEA（Gene Set Enrichment Analysis）を行った。HOT群はすべての癌腫でIFN-γ pathwayの活性化と強い相関が見られた、COLDは癌腫特異的に複数のシグナルpathwayと関連していた。乳がんにおいてはER pathway、大腸がんにおいてはβ-catenin pathwayが、肝がんにおいては複数の代謝経路が、T-cell COLDと強い相関を示していた。さらに、TCGAのデータと理研でのアジア人に多い癌腫（食道がん、胃がん、胆道がんなど）データを加えて免疫ゲノム解析を行い（追加約4000例）、癌種横断的免疫ゲノムプロファイルを拡大した。化学療法前の食道扁平上皮がん生検サンプルの免疫ゲノム解析を行い、免疫signature解析と化学療法の奏効率との関連を見出した。肝がんについては、腫瘍および非腫瘍部の肝炎組織のRNA発現データから腫瘍内の免疫抑抑制機構の解明を行い、４つの免疫抑制機構が機能しており、これら免疫抑制機構にもとづく４つ分子分類を確立した。この免疫的な層別化によって、免疫チェックポイント阻害剤の効果の有無が層別化できる可能性がある。