シアノバクテリアは光合成を行う原核生物の一群であり、植物の光合成機能の解明、アオコの発生機構の解明、遺伝子改変によるバイオマス生産等、基礎から応用までの幅広い研究の材料として利用されている。我が国においてシアノバクテリアは、ナショナルバイオリソースプロジェクトの中核機関である国立環境研究所（NIES）の藻類コレクションにて５６属９３３株が管理され、国内外の幅広い研究者に利用されている。近年の次世代シークエンサーの普及に伴い、各国のカルチャーコレクションに集積された多様なシアノバクテリアのゲノムを網羅的に解析する取り組みが行われているが（Shih et al 2013 Proc. Natl. Acad. Sci.等）、NIESコレクションのゲノム解析株は、本事業以前は５株にとどまっていた。そこで本事業では、NIESコレクションに集積されたシアノバクテリアのゲノム情報整備に取り組んだ。本年度は、ゲノムサイズが大きく、高精度なゲノム情報の整備が世界的に遅れているヘテロシスト形成グループの３１株のゲノム解析を行った。シアノバクテリアの培養とゲノムDNAの抽出は国立環境研究所、次世代シークエンサーを用いたゲノム解析は豊橋技術科学大学、遺伝子のアノテーションとデータ公開を国立遺伝学研究所が担当した。次世代シークエンサーによって構築できるゲノムの塩基配列の完成度は、短いサイズに分断されたContig（コンティグ）、コンティグ間の位置関係を明らかにしたScaffold（スキャッフォールド）、スキャッフォールド間の位置関係を明らかにして染色体が１つにつながったChromosome（染色体）、染色体の全てのギャップの配列を決定したComplete（完全）の４つのレベルに大別され、後半のレベルほど高精度なゲノム情報である。本事業では、ゲノム解析を行った３１株のうち、Completeレベルのゲノムを７株、Chromosomeレベルのゲノムを２３株、Scaffoldレベルのゲノムを１株決定した。これらの株のゲノムの塩基配列について、遺伝子予測と高精度アノテーション付与を、DFASTパイプラインを用いて実施した（https://dfast.nig.ac.jp/）。これまでに事業担当者が解析してきた９株のNIES株も合わせ、合計４０株のゲノム情報をデータベースCyanoBaseにて公開した（http://genome.microbedb.jp/cyanobase）。平成２８年度３月時点で、Chromosomeレベル以上にアセンブルされた高精度なシアノバクテリアのゲノムの塩基配列は約１６０株が公開され、本事業の取り組みによってその約１／４がNIESコレクション由来となり、当該分野における我が国のプレゼンスは大きく向上した。また、我が国独自のリソースであるNIESコレクションのシアノバクテリアの新たなユーザーの獲得が期待できる。加えて、本事業により、多様なシアノバクテリア株の維持や管理を専門とする研究者、次世代シークエンス解析を専門とする研究者、データ公開を専門とする研究者の間の連携が促進され、国内のゲノム研究の底上げにも貢献した。