AMED研究開発課題データベース 日本医療研究開発機構(AMED)の助成により行われた研究開発の課題や研究者を収録したデータベースです。

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研究課題情報

研究課題名
血液循環腫瘍DNA解析を活用した切除不能・進行再発大腸がんにおけるがんゲノム異常のClonal Evolutionに関する網羅的カタログの作成
課題管理番号
20ck0106445h0003
統合プロジェクト
疾患基礎研究プロジェクト
9つの連携分野プロジェクト
ジャパン・キャンサーリサーチ・プロジェクト
事業名
革新的がん医療実用化研究事業
タグ(2020)
/研究の性格/新規診断法・検査法・検査体制の開発、確立、検証<診断薬・診断機器開発は除く>
/開発フェーズ/基礎的
/承認上の分類/体外診断薬
/対象疾患/新生物
タグ(2019)
/研究の性格/新規診断法・検査法・検査体制の開発、確立、検証<診断薬・診断機器開発は除く>
/開発フェーズ/該当なし
/承認上の分類/薬機法分類非該当
/対象疾患/新生物
タグ(2018)
/研究の性格/新規診断法・検査法・検査体制の開発、確立、検証<診断薬・診断機器開発は除く>
/開発フェーズ/該当なし
/承認上の分類/薬機法分類非該当
/対象疾患/新生物
代表研究機関
国立研究開発法人国立がん研究センター
研究代表者
(2020) 中村能章 , 国立研究開発法人国立がん研究センター , 東病院 消化管内科・医員
(2019) 中村能章 , 国立研究開発法人国立がん研究センター , 東病院 消化管内科・医員
(2018) 中村能章 , 国立研究開発法人国立がん研究センター , 東病院消化管内科・がん専門修練医
データサイエンティスト
山下理宇 国立研究開発法人国立がん研究センター 先端医療開発センター, ユニット長
研究期間
2018年度-2020年度
課題への総配分額

(単位:千円)

  • 40,560
  • 2020年度
    20,800
  • 2019年度
    10,010
  • 2018年度
    9,750
研究概要(2020)
カタログのデータセットを用いて、患者背景、化学療法歴、予後とがんゲノム異常の変化の関連について解析する。Kaplan-Meier曲線を全てのパラメータの元に求め、差が出て来る物を抽出する。 全てのデータに関してそれぞれの相関をとりp値の低い物を集めて得られた集団を考察することで新たな医学・生物学的な情報抽出を目指す。 TRIUMPH試験、BRAVERY試験、BIG BANG試験、TMB-Highバスケット試験、MET BEIGE試験それぞれで収集した臨床情報(患者背景、化学療法歴、予後情報等)及びGOZILA研究で評価した治療前、増悪後のctDNA解析結果を抽出し、作成した手順に準じてカタログへ追加する。 臨床情報、治療効果及びゲノム異常の変化の関連について解析する。
研究概要(2019)
GI-SCREENの腫瘍組織ゲノムデータ及び臨床情報とGOZILAのctDNAゲノムデータ及び臨床情報を比較解析できるよう、それぞれのデータのクリーニング及びカタログ作成を行う。データのクリーニングには初年度に確立した手法を用いる。また、公的アノテーションデータベースと結合できるリレーショナルデータベースとすることで、異なるアッセイを用いたNGS解析結果を比較可能にする。大腸がんの希少フラクションを対象とした医師主導治験において、研究計画書に準じて血液検体、腫瘍組織を採取し保管し、全エクソーム解析、RNA-seq、RTKアレイ、ウェスタンブロット解析、免疫組織化学的染色を行い、これらのデータのmultiomics解析をし、治療効果との関連を探索する。
研究概要(2018)

研究成果情報

【成果報告書】

成果の概要
GI-SCREEN開始~2019年4月までのGI-SCREEN登録症例5743例、GOZILA開始~2019年8月までのGOZILA登録症例1787例について、データクリーニングを行い、リレーショナルデータベースを作成した。まずctDNA解析の臨床的有用性を検証するために、GI-SCREEN及びGOZILAに登録された症例において、治験への登録割合について評価したところ、GOZILAではGI-SCREENと比較してスクリーニング検査の特性が有意に改善されていることが明らかになった。検体の利用割合、シークエンシング成功割合、検体を検査ラボへ提出するまでの期間期間、検査期間が、GI-SCREENと比較してGOZILAで全て有意に良好であった。Actionableな遺伝子異常が同定された症例における治験登録割合はGI-SCREENで4.1%、GOZILAで9.5%であった(P <0.0001)。さらに、治験の治療効果は奏効割合が16.7%、20.0%で、無増悪生存期間中央値が2.8か月、2.4か月と両群で有意な差を認めなかった。これらの結果より、ctDNA解析は従来の組織解析と比較して、治療効果を落とすことなく効率的にゲノム異常に基づく治療へ登録できることが明らかになり、臨床的にctDNAと組織の解析は同様に取り扱うことが妥当であることが確認された。つづいて、構築したカタログのデータセットを利用し、RAS野生型大腸癌について抗EGFR抗体薬使用前の腫瘍組織データを説明変数、リキッドバイオプシーの遺伝子異常データを目的変数として機械学習を行い、必要に応じてアンサンブル学習を行って変異獲得の予測モデル構築を行った結果、従来の抗EGFR抗体薬によるRAS変異のみならず、特定のゲノム異常、治療と関連して出現する遺伝子異常が同定され、これらの予測が可能となった。最後に、HER2陽性大腸がんを対象とした医師主導治験TRIUMPH試験において、トラスツズマブ+ペルツズマブ治療後に、様々な遺伝子異常、特にMAPK・RTK関連の遺伝子異常といった、抗EGFR抗体薬の獲得耐性として生じる遺伝子異常と同様のパターンのClonal Evolutionが確認された。
学会誌・雑誌等における論文一覧
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1.Nakamura Y, Kawazoe A, Lordick F, Janjigian YY, Shitara K. Biomarker-targeted therapies for advanced-stage gastric and gastro-oesophageal junction cancers: an emerging paradigm. Nat Rev Clin Oncol. 2021 Mar 31. doi: 10.1038/s41571-021-00492-2

2.Kagawa Y, Elez E, Garcia-Foncillas J, Bando H, Taniguchi H, Vivancos A, Akagi K, Garcia A, Denda T, Ros J, Nishina T, Baraibar I, Komatsu Y, Ciardiello D, Oki E, Kudo T, Kato T, Yamanaka T, Tabernero J, Yoshino T. Combined Analysis of Concordance between Liquid and Tumor Tissue Biopsies for RAS Mutations in Colorectal Cancer with a Single Metastasis Site: The METABEAM Study. Clin Cancer Res. 2021 Feb 18:clincanres.3677.2020. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-20-3677. Epub ahead of print.

3.Kobayashi S, Nakamura Y, Takahashi S, Taniguchi H, Yoshino T. ASO Author Reflections: Circulating Tumor DNA (ctDNA) as a Potentially Practice-Changing Innovation to Evolve Precision Onco-Surgery" in Resectable Colorectal Liver Metastases. Ann Surg Oncol. 2021 Jan 4. doi: 10.1245/s10434-020-09456-9"

4.Kobayashi S, Nakamura Y, Taniguchi H, Odegaard JI, Nomura S, Kojima M, Sugimoto M, Konishi M, Gotohda N, Takahashi S, Yoshino T. Impact of Preoperative Circulating Tumor DNA Status on Survival Outcomes After Hepatectomy for Resectable Colorectal Liver Metastases. Ann Surg Oncol. 2021 Jan 3. doi: 10.1245/s10434-020-09449-8

5.Nakamura Y, Sasaki A, Yukami H, Jogo T, Kawazoe A, Kuboki Y, Taniguchi H, Yamashita R, Kuwata T, Ozawa M, Nakamura M, Yoshino T, Shitara K. Emergence of Concurrent Multiple EGFR Mutations and MET Amplification in a Patient with EGFR-Amplified Advanced Gastric Cancer Treated with Cetuximab. JCO Precis Oncol. 2020 Nov 17;4:PO.20.00263. doi: 10.1200/PO.20.00263

6.Ebi H, Bando H, Taniguchi H, Sunakawa Y, Okugawa Y, Hatanaka Y, Hosoda W, Kumamoto K, Nakatani K, Yamazaki K. Japanese Society of Medical Oncology Clinical Guidelines: Molecular Testing for Colorectal Cancer Treatment, 4th edition. Cancer Sci. 2020 Oct;111(10):3962-3969. doi: 10.1111/cas.14567

7.Nakamura Y, Taniguchi H, Ikeda M, Bando H, Kato K, Morizane C, Esaki T, Komatsu Y, Kawamoto Y, Takahashi N, Ueno M, Kagawa Y, Nishina T, Kato T, Yamamoto Y, Furuse J, Denda T, Kawakami H, Oki E, Nakajima T, Nishida N, Yamaguchi K, Yasui H, Goto M, Matsuhashi N, Ohtsubo K, Yamazaki K, Tsuji A, Okamoto W, Tsuchihara K, Yamanaka T, Miki I, Sakamoto Y, Ichiki H, Hata M, Yamashita R, Ohtsu A, Odegaard JI, Yoshino T. Clinical utility of circulating tumor DNA sequencing in advanced gastrointestinal cancer: SCRUM-Japan GI-SCREEN and GOZILA studies. Nat Med. 2020 Oct 5. doi: 10.1038/s41591-020-1063-5

8.谷口浩也. Cell free DNAを用いた治療戦略.がん分子標的治療;18(2):219-222. 2021年1月

9.石井貴大, 中村能章, 血液循環腫瘍DNA 解析に基づく進行固形悪性腫瘍に対するPrecision Medicine. 癌と化学療法;47(12):1645-1652, 2020年12月

10.石井貴大, 中村能章. 消化器癌における血液循環腫瘍DNA 解析の展望. 医学のあゆみ;275(4):424-430. 2020年12月

11.由上博喜, 中村能章. がん遺伝子パネル検査を基にした医師主導治験. Pharm stage;20(8): 46-51, 2020年11月

12.洞澤智至, 中村能章. 図説「がんゲノム医療」シリーズ(No.10)腫瘍遺伝子変異量(TMB)と免疫チェックポイント阻害剤. 医療;74(10): 451-454, 2020年10月

13.谷口浩也.【遺伝性腫瘍とゲノム医療を学ぶ】ゲノム医療 SCRUM-Japan GI-SCREENの成果と今後の展望. 臨床外科;75(8):953 - 957. 2020年8月

14.谷口浩也.「がんゲノム医療」シリーズ(No.7) 消化管がんのゲノム医療医療;74(7):340- 343. 2020年7月

15.洞澤智至, 中村能章. 血液循環腫瘍DNAスクリーニングにもとづく治癒切除不能な進行・再発消化器がんに対する臨床開発の現状と展望. 腫瘍内科;25(6):650-659, 2020年6月

16.大腸癌におけるprecision medicineの可能性 大腸癌に対するprecision medicineの課題と展望, 谷口 浩也, 日本大腸肛門病学会雑誌 73(9) A35 - A35 2020年9月

17.消化器癌化学療法における個別化医療の現状と課題 消化器癌個別化医療実現に向けたSCRUM-Japan GI-SCREENの取り組み. 谷口 浩也, 吉野 孝之, 大津 敦. 日本消化器病学会雑誌 117(臨増総会) A31 - A31 2020年7月

学会・シンポジウム等における口頭・ポスター
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1.Landscape of genomic alterations of circulating tumor DNA in advanced genitourinary cancer patients: SCRUM-Japan MONSTAR SCREEN Project, Nobuaki Matsubara, Taigo Kato, Takao Fujisawa, Masaki Shiota, Masatoshi Eto, Takahiro Osawa, Takashige Abe, Nobuo Shinohara, Yota Yasumizu, Nobuyuki Tanaka, Mototsugu Oya, Koshiro Nishimoto, Satoshi Horasawa, Naomi Kuramoto, Yoshiaki Nakamura, Hiroya Taniguchi, Takayuki Yoshino, Norio Nonomura, ASCO GI 2021, 2021/01/15, 国外, ポスター.

国外 / ポスター

2.Characteristics of genomic alterations in circulating tumor DNA (ctDNA) in patients (Pts) with advanced gastrointestinal (GI) cancers in nationwide large-scale ctDNA screening: SCRUM-Japan Monstar-Screen, Yoshiaki Nakamura, Takao Fujisawa, Shigenori Kadowaki, Naoki Takahashi, Masahiro Goto, Kazuhiro Yoshida, Takeshi Kawakami, Taito Esaki, Eiji Oki, Naohiro Nishida, Tomohiro Nishina, Yoshito Komatsu, Takashi Ohta, Naomi Kuramoto, Satoshi Horasawa, Yasutoshi Sakamoto, Hiroya Taniguchi, Takayuki Yoshino, ASCO GI 2021, 2021/01/15, 国外, ポスタ―.

国外 / ポスター

3.METABEAM study: Combined analysis of concordance studies between liquid and tissue biopsies for RAS mutations in colorectal cancer patients with single metastatic sites, Y. Kagawa, E. Elez Fernandez, J. Garcia-Foncillas, T. Yamanaka, J. Tabernero, T. Yoshino, ESMO-GI 2020, 2020/07/03, 国外, 口頭.

国外 / 口頭

4.A multicenter phase II study of eribulin in patients with BRAF V600E mutant metastatic colorectal cancer: BRAVERY study (EPOC1701), T. Masuishi, H. Taniguchi, D. Kotani, H. Bando, Y. Komatsu, E. Shinozaki, T. Nakajima, T. Satoh, T. Nishina, T. Esaki, M. Wakabayashi, S. Nomura, K. Takahashi, H. Ono, N. Hirano, N. Fujishiro, N. Fuse, A. Sato A. Ohtsu, T. Yoshino, ESMO-GI 2020, 2020/07/03, 国外, 口頭.

国外 / 口頭

5.REMARRY and PURSUIT trials: Liquid biopsy-guided re-challenge of anti-EGFR monoclonal antibody for patients with RAS/BRAF V600E wild-type metastatic colorectal cancer, H. Nakajima, D. Kotani, E. Oki, T. Kato, E. Shinozaki, Y. Sunakawa, H. Bando, K. Yamazaki, S. Yuki, T. Yoshino T. Yamanaka, T. Ohta, H. Taniguchi, Y. Kagawa, ESMO-GI 2020, 2020/07/01, 国外, ポスター.

国外 / ポスター

6.Utility of circulating tumor DNA (ctDNA) versus tumor tissue clinical sequencing for enrolling patients (pts) with advanced non-colorectal (non-CRC) gastrointestinal (GI) cancer to matched clinical trials: SCRUM-Japan GI-SCREEN and GOZILA combined analysis, Akihiro Ohba, Yoshiaki Nakamura, Hiroya Taniguchi, Masafumi Ikeda, Hideaki Bando, Nobumasa Mizuno, Ken Kato, Chigusa Morizane, Tomohiro Nishina, Makoto Ueno, Junji Furuse, Hiroki Hara, Tadamichi Denda, Hisato Kawakami, Taito Esaki, Toshikazu Moriwaki, Hisateru Yasui, Yoshito Komatsu, Takayuki Yoshino, Atsushi Ohtsu, ASCO 2020, 2020/05/29, 国外, ポスター.

国外 / ポスター

7.Utility of circulating tumor DNA (ctDNA) versus tumor tissue genotyping for enrollment of patients with metastatic colorectal cancer (mCRC) to matched clinical trials: SCRUM-Japan GI-SCREEN and GOZILA combined analysis, Yoshiaki Nakamura, Hiroya Taniguchi, Hideaki Bando, Taito Esaki, Yoshito Komatsu, Ken Kato, Naoki Takahashi, Yoshinori Kagawa, Takeshi Kato, Tomohiro Nishina, Taroh Satoh, Eiji Oki, Yu Sunakawa, Manabu Shiozawa, Yoshiyuki Yamamoto, Hisato Kawakami, Tadamichi Denda, Atsushi Ohtsu, Takayuki Yoshino, ASCO 2020, 2020/05/29, 国外, ポスター.

国外 / ポスター

8.A basket trial of trastuzumab deruxtecan, a HER2-targeted antibody-drug conjugate, for HER2-amplified solid tumors identified by circulating tumor DNA analysis (HERALD trial), Masataka Yagisawa, Yoshiaki Nakamura, Takayuki Yoshino, Yoshito Komatsu, Shigenori Kadowaki, Kei Muro, Yu Sunakawa, Taroh Satoh, Tomohiro Nishina, Taito Esaki, Satoshi Fujii, Hiromi Ono, Daiki Tomita, Noriko Fujishiro, Nami Hirano, Nozomu Fuse, Akihiro Sato, Gakuto Ogawa, Shogo Nomura, Hiroya Taniguchi, ASCO 2020, 2020/05/29, 国外, ポスター.

国外 / ポスター

9.Genomic Alterations in Circulating Tumor DNA (ctDNA) in Advanced Gastrointestinal Cancers: SCRUM-Japan MONSTAR-SCREEN, 舛石 俊樹, 藤澤 孝夫, 高橋 直樹, 後藤 昌弘, 吉田 和弘, 川上 武史, 江﨑 泰斗, 沖 英次, 佐藤 太郎, 仁科 智裕:, 小松 嘉人, 太田 高志, 倉本 尚美, 洞澤 智至, 坂本 泰理, 中村 能章, 谷口 浩也, 吉野 孝之, 第18回日本臨床腫瘍学会・PS3-1, 2021/02/21, 国内, 口頭.

国内 / 口頭

10.Genomic characterization of circulating tumor DNA in advanced genitourinary cancer patients SCRUM-Japan MONSTAR SCREEN, 野々村 祝夫, 加藤 大悟, 藤澤 孝夫, 塩田 真己, 江藤 正俊, 大澤 崇宏, 安部 崇重, 篠原 信雄, 安水 洋太, 田中 伸之, 大家 基嗣, 西本 紘嗣郎, 洞澤 智至, 倉本 尚美, 中村 能章, 谷口 浩也, 吉野 孝之, 松原 伸晃, 第18回日本臨床腫瘍学会・PS3-2, 2021/02/21, 国内, 口頭.

国内 / 口頭

11.A multicenter phase II study of eribulin in BRAF V600E mutant metastatic colorectal cancer: BRAVERY study (EPOC1701), 佐藤 太郎, 舛石 俊樹, 藤澤 孝夫, 高橋 直樹, 後藤 昌弘, 吉田 和弘, 川上 武史, 江崎 泰斗, 沖 英次, 仁科 智裕, 小松 嘉人, 太田 高志, 倉本 尚美, 洞澤 智至, 坂本 泰理, 中村 能章, 谷口 浩也, 吉野 孝之, 第18回日本臨床腫瘍学会・MO17-4, 2021/02/20, 国内, 口頭.

国内 / 口頭

12.Genomic alterations in circulating tumor DNA in patients with advanced gynecologic cancer: SCRUM-Japan MONSTAR SCREEN, 千代田 達幸, 藤澤 孝夫, 原野 謙一, 大神 達寛, 加藤 聖子, 坂井 美佳, 竹原 和宏, 井平 圭, 渡利 英道, 竹中 基記, 森重 健一郎, 洞澤 智至, 倉本 尚美, 坂本 泰理, 中村 能章, 谷口 浩也, 吉野 孝之, 青木 大輔, 第18回日本臨床腫瘍学会・O9-3, 2021/02/20, 国内, 口頭.

国内 / 口頭

13.Circulating Tumor DNA (ctDNA) Genotyping of Advanced Head and Neck (HN) Cancers: SCRUM-Japan MONSTAR-SCREEN, 門脇 重憲, 藤澤 孝夫, 佐竹 悠良, 洞澤 智至, 倉本 尚美, 坂本 泰理, 中村 能章, 谷口 浩也, 吉野 孝之, 岡野 晋, 第18回日本臨床腫瘍学会・MO3-5, 2021/02/19, 国内, 口頭.

国内 / 口頭

14.Genomic landscape of Circulating Tumor DNA (ctDNA) in Hepatobiliary and pancreatic Cancers: SCRUM-Japan MONSTAR-SCREEN, 渡邊 一雄, 藤澤 孝夫, 森実 千種, 大場 彬博, 古川 正幸, 伊藤 心二, 上野 誠, 佐竹 悠良, 砂川 優, 辻本 彰子, 大坪 公士郎, 後藤 昌弘, 水野 伸匡, 洞澤 智至, 倉本 尚美, 坂本 泰理, 中村 能章, 谷口 浩也, 吉野 孝之, 池田 公史, 第18回日本臨床腫瘍学会・O5-2, 2021/02/19, 国内, 口頭.

国内 / 口頭

15.Genomic Landscape of Circulating Tumor DNA (ctDNA) in Patients with Advanced Breast Cancer: SCRUM-Japan MONSTAR-SCREEN, 山中 隆司, 藤澤 孝夫, 内藤 陽一, 服部 正也, 増田 慎三, 山下 年成, 能澤 一樹, 深澤 陽子, 八十島 宏行, 松原 由佳, 向原 徹, 大谷 陽子, 洞澤 智至, 倉本 尚美, 坂本 泰理, 中村 能章, 谷口 浩也, 吉野 孝之, 岩田 広治, 第18回日本臨床腫瘍学会・O4-4, 2021/02/19, 国内, 口頭.

国内 / 口頭

16.Landscape of bTMB and HRD in circulating tumor DNA (ctDNA) across advanced solid tumors: SCRUM-Japan MONSTAR-SCREEN, 藤澤 孝夫, 中村 能章, 森実 千種, 野々村 祝夫, 岩田 広治, 岡野 晋, 青木 大輔, 山崎 直也, 洞澤 智至, 倉本 尚美, 坂本 泰理, 谷口 浩也, 吉野 孝之, 第18回日本臨床腫瘍学会・O4-1, 2021/02/19, 国内, 口頭.

国内 / 口頭

17.がん診療における血中循環腫瘍DNA解析の現状と未来のパラダイム, 中村 能章, 第18回日本臨床腫瘍学会, 2021/02/18, 国内, 口頭.

国内 / 口頭

18.胆道癌におけるゲノム医療の開発 HER2陽性胆道癌に対する医師主導治験, 大場 彬博, 森実 千種, 吉野 孝之, 2020年度日本消化器関連学会週刊(JDDW2020), 2020/11/06, 国内, 口頭.

国内 / 口頭

19.がんゲノム医療の癌治療への貢献 消化器がんにおけるがんゲノム医療の現状と展望 内科医の立場から, 谷口 浩也, 第58回日本癌治療学会学術集会, 2020/10/22, 国内, 口頭.

国内 / 口頭

20.がんのシングルセルおよび空間トランスクリプトーム解析, 鈴木 穣, 第79回日本癌学会学術総, 2020/10/1-2020/10/3, 国内, 口頭

国内 / 口頭



更新日:2022-05-11

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